一般纳税人预缴增值税扣除的分包款是含税金额。根据税务部门的解释，任何一个单位都需要为分包款支付增值税，因此可以推断，分包款应按含税金额预缴增值税，即预缴增值税应纳税额是在采购分包款的总金额基础上再加上增值税税额。 拓展知识：根据税务部门的有关规定，一般纳税人购买的分包款或服务，除享受免征外，仍然需要申报并缴纳增值税。一般纳税人可以按月抵扣增值税，并在报税时可以抵扣报销。但是，在申报时要根据实际情况申报，绝不能以未缴纳的分包款为基础申报增值税。