公司为物流企业，在外地没有车辆但有代理运输业务；在外地的运输业务，第三方运输公司给我司开的是9%的运输发票，我司因为代理运输业务属于现代服务，只能开6%的代理运输发票。现提问：我司只能开6%的代理运输发票，对应进项9%的发票的进项税额是不是不能直接全部用于进项抵扣？