先扣员工个税之后再申报，是这样的，依据现行《个人所得税法》第九条以及将于2019年1月1日起实施的《个人所得税法》第十四条，扣缴义务人应该在发放工资的次月15日内办理扣缴或预扣缴申报。例如，某单位2018年10月12号发放工资，那么单位就应该在11月15号前向税务机关申报缴纳这笔工资对应的个人所得税，填报扣缴申报表时，该笔税款的税款所属期应为10月份。