老师，我单位请施工方做了一个工程，工程合同价格和决算价一样，决算价假设30万，我单位做了结算审核，核定价假设28万。我单位在付款时按28万的97%即27.16万付，留3%做质保金。施工方按30万的97%开了增值税普通发票，金额为29.1万。这样问题就是我的付款金额和发票金额对不上，做账时怎么处理？可以让对方重新开票吗？（好像比较困难），不能重新开票的情况下，要怎么处理？