在实际操作中，如果指定购房者购房款实际支付金额低于抵房协议中的抵房金额，建议补充一份协议。 理由如下： 一、明确双方权利义务 原抵房协议通常是基于特定的抵房金额而签订的，实际支付金额的变化可能导致双方在权利义务方面出现新的情况。补充协议可以明确双方对于新的支付金额的认可，以及可能涉及的其他条款调整，如房屋交付标准、违约责任等。 例如，若购房者实际支付金额减少，可能需要明确开发商在房屋交付方面是否会有相应调整，或者是否会影响房屋的产权办理等事项。 对于购房者来说，补充协议可以保障其合法权益，避免因支付金额变化而产生不必要的纠纷。比如，明确购房者按照新的支付金额履行义务后，开发商应按时交付房屋并承担相应的质量保证责任。 二、避免法律风险 没有补充协议的情况下，双方对于支付金额的变更可能存在争议，一旦发生纠纷，可能难以确定双方的责任和权利。补充协议可以作为法律依据，明确双方的约定，降低法律风险。 例如，如果在后续过程中出现开发商要求购房者按照抵房协议中的金额支付剩余款项的情况，购房者可以依据补充协议进行抗辩。 从税务角度考虑，支付金额的变化可能影响到相关税费的计算和缴纳。补充协议可以对税务方面的问题进行明确约定，避免因税务问题引发的纠纷。