在增值税的计算中，一般纳税人应纳税额 = 当期销项税额 - 当期进项税额。 如果销项预缴后，分包方（即进项提供方）也预缴，最终计算应纳税额时，确实是销项税额减去进项税额，预缴的部分可以在申报纳税时进行抵减。 如果进项先预缴，销项预缴时通常也不是只需缴差额。销项预缴和进项预缴是两个相对独立的预缴行为，在最终计算应纳税额时，同样是用当期销项税额减去当期进项税额，再考虑预缴部分的抵减情况来确定实际应缴纳的税款。