首先，A公司收到的100万货款，应在其账上做如下分录：借记“银行存款”100万，贷记“应收账款”或“主营业务收入”100万。然后，如果是将资金转给B公司，A公司需要做的分录是：借记“应付账款-B公司”100万，贷记“银行存款”100万。B公司则相应地借记“银行存款”100万，贷记“应收账款-A公司”100万。这样处理后，资金在账面上从A公司转移到B公司。