这道题的意思是：甲公司向人民法院提起诉讼，但是在人民法院首次开庭前，乙公司向法院提交了有效的仲裁协议。 这种情况并不是一方有诉讼一方有仲裁，而是双方可能在合同中约定了仲裁条款，但甲公司在提起诉讼时未声明有仲裁协议，人民法院受理了诉讼。当乙公司在首次开庭前提交有效的仲裁协议后，根据法律规定，人民法院应当驳回甲公司的起诉，因为双方存在有效的仲裁协议，应当通过仲裁解决争议，而不是由人民法院审理