企业补缴的土地出让金应计入“无形资产”科目。 根据《企业会计准则第6号——无形资产》第七条规定：外购无形资产的成本，包括购买价款、相关税费以及直接归属于使该项资产达到预定用途所发生的其他支出。补缴土地出让金可视同外购土地使用权的成本，应当计入“无形资产”科目。 具体账务处理为：补缴土地出让金时，借记“无形资产-土地使用权”科目，贷记“银行存款”等科目。