在总公司进行季度合并报表时，如果分公司是非独立核算的，可以对冲总分公司之间的往来款。 非独立核算的分公司通常没有完整的会计凭证和会计账簿体系，其经济业务的核算由总机构完成。在这种情况下，总公司和分公司之间的资金往来，如总公司拨款给分公司用于发放工资等，通常会在总机构的账目中体现为内部往来款项。当编制合并报表时，根据会计准则和实务处理，公司内部的往来款项可以进行对冲处理，以反映整个企业集团的真实财务状况。