一般来说，如果新成立的公司卖燕窝，现在要开发票，需要在税务局申请对应的燕窝类目的税种和税率，并在开票系统中添加对应的商品编码，才能正常开具燕窝发票。如果没有购进货物，只是总公司有燕窝，可以考虑先从总公司采购燕窝，再由新公司销售。这样可以保证销售的燕窝是合法的，并且能够正常开具发票。但具体操作还需根据当地税法和相关规定进行，建议咨询专业会计师或律师。