加计扣除5%的进项税后，计算对应的附加税时，应该按照加计扣除前的实际增值税进项税额计提。加计扣除5%的进项税是一种税收优惠政策，用于鼓励企业增加研发投入，提高创新能力。在实际操作中，企业可以在计算应纳税额时，按照规定加计扣除5%的进项税额，从而减少应纳税额。但是，在计算附加税时，应该以加计扣除前的实际增值税进项税额为基础进行计算，因为附加税是依据实际缴纳的增值税税额来计提的。因此，如果企业享受了加计扣除5%的进项税政策，那么在计算附加税时，应该以加计扣除前的实际增值税进项税额为基础进行计算，而不是扣除后的金额。