根据《中华人民共和国印花税法》，公司与农民签署的种植合作协议属于“财产租赁合同”，应当按价款的0.05%缴纳印花税。至于土地流转税，根据《中华人民共和国契税法》，土地流转的承受的单位和个人为契税的纳税人，应当按价款的0.05%缴纳契税。 具体金额的计算方式为： 印花税 = 协议价款 × 0.05%。 契税 = 协议价款 × 0.05%。 需要注意的是，具体税收政策可能会因地区和时间而有所不同，建议咨询当地税务部门