正确答案是：D.关于提高科学基金项目和资金管理的通知。 《关于进一步完善科学基金项目和资金管理的通知》的规章制度体系及重点包括： A项，国家自然科学基金资助项目资金管理办法。 B项，关于国家自然科学基金资助项目资金管理有关问题的补充通知。 C项，关于国家自然科学基金资助项目资金管理的补充通知。 D项，该通知并没有涉及到《关于提高科学基金项目和资金管理的通知》，故不选。 综上，本题答案为D。