劳务公司在支付农民工工资后，需要申报个人所得税。根据《中华人民共和国个人所得税法》的规定，由建筑劳务公司发放的工资薪金应该缴纳个人所得税。劳务公司应在发放工资薪金前或发放后，当月内按月向税务机关申报缴纳个人所得税。申报时，应填写《个人所得税月度预缴纳税申报表》，表中记录建筑劳务公司发放给工人的工资薪金和个人所得税额等信息，税务机关和建筑劳务公司根据发放的薪金计算税款。