对于东莞市内资生产企业的出口退税，如果企业已经进行了出口退（免）税备案，并选择了免抵退税的计算方法，那么企业不能只进行免税申报。 根据东莞市出口退税的相关规定，企业必须按照免抵退税的计算方法计算出口退税，并按照相关流程进行申请和审批。即使企业的出口业务不多，也必须按照规定的流程进行出口退税申报。 因此，如果企业想要享受出口退税政策，必须按照相关规定进行出口退（免）税备案，并按照规定的计算方法和流程进行出口退税申报。