当子公司注销时，其盈余公积和未分配利润应当按照以下步骤进行会计处理： 1.子公司清算时，应当将账上的存货进行报废处理。 2.如果存货还可以进行销售，应当做销售处理，并计提增值税和附加税。 3.如果注销时分配给股东或者无偿赠送给股东，视同为销售处理，并缴纳增值税。 4.对于未付清的欠款，理论上公司注销就意味着公司法人主体资格的灭失，注销后原有的债务也就一笔勾销。