根据《企业所得税法实施条例》规定：签证代理服务机构提供代理服务收取的费用属于服务业中的代理业务收入，应当以基础服务收取的全部价款和价外费用按一般纳税人的税率全额开具增值税发票。因此，签证代理服务机构应当在提供代理服务并收取全部价款和价外费用的时点进行收入确认。 在实际操作中，一般而言，签证代理服务机构在收到客户支付的款项时，应当确认收入。即在收到客户支付的款项时，借记银行存款账户，贷记主营业务收入，同时计提相关税金及附加。