根据《中华人民共和国审计法》和《中华人民共和国审计法实施条例》的规定，工程子项目的结算审计和整体工程的财务竣工决算都是审计机关对建设项目的监督和审查，两者有一定的先后顺序。 一般来说，工程子项目的结算审计应当在工程子项目完工并通过验收后进行。结算审计是对工程子项目的实际完成情况和费用支出进行审查和核实，以确保工程子项目的建设符合规划要求，且资金使用合理、合法。在结算审计完成后，才能进行整体工程的财务竣工决算。 整体工程的财务竣工决算是在所有工程子项目都完成并通过验收后，对整个建设项目的投资效益、资金使用情况、建设成本等方面进行全面、系统的分析和总结。在财务竣工决算完成后，才能最终确定建设项目的投资效益和财务状况。 因此，事业单位支付基建工程子项目尾款的时间应当根据具体情况而定，一般在结算审计完成后进行。如果未经过结算审计或财务竣工决算，事业单位应当暂停支付尾款，以避免资金使用不当或出现其他问题。