支付转让费通常不算是店铺经营权的转让。支付转让费通常是为了获得某些特定的资产或权利，例如：设备、品牌、特许经营权或者知识产权等。这种情况下，支付的转让费是对这些资产或权利的购买费用，而不是对店铺经营权的购买。 在某些情况下，如果二房东将店铺的经营权和设施设备一起转让给了另一方，那么可能会涉及到店铺经营权的转让。这通常会在合同或协议中明确规定。然而，单纯的以设施设备作为标的物的支付转让费并不等同于店铺经营权的转让。