报关单上的境内货源地和发票上的不一致是会影响退税的，要取得出口退税必须使货源地和报关资料产地一致。依据《中华人民共和国进出口货物原产地条例》第二十四条：进口货物的原产地标记与依照本条例所确定的原产地不一致的，由海关责令改正。出口货物的原产地标记与依照本条例所确定的原产地不一致的，由海关、出入境检验检疫机构责令改正。所以，开票资料地址要和报关单上的境内货源地一致才能退税。如果发票上地址有错，应该作废重开；如果报关人员操作或者书写失误造成所申报的报关单内容有误，并且未发现有走私违规或者其它违法嫌疑的，企业可以向海关申请改单