根据《中华人民共和国增值税暂行条例》第十四条：“纳税人应当根据本单位的实际经营地点，向所在地的税务机关申报纳税。”因此，小规模纳税人公司在1月份开出26万的3%的专票后，4月份应当向杭州税务机关申报纳税。 拓展知识：征收增值税是一种货物及劳务消费税，它是以经济活动中货物及劳务价值增加的过程中所形成的价值增值税，是当前国家的重要税收来源之一。