修改员工的社保基数需要按照正确的程序进行操作。首先，确保员工提交了正确的社保相关单据；其次，完善员工档案中的个人社会保险相关内容；最后，将新的社保基数输入到公司相关社保人员档案中。对于社保基数，其实在缴费前，可以根据国家有关规定对原有基数进行调整，以确保员工的社保得到及时准确的补缴。拓展知识：此外，参加社会保险的企业应当在有关文件的基础上，定期提供社会保险信息，并及时报告各类变动情况，以免造成社保信息及交费不完善的情况。