是的，厂房可以抵扣小规模企业取得的房产增值税专用发票。通常，小规模企业在转为一般纳税人后，仍然可以使用小规模已增值税专用发票作为财务凭证，可以参考政府的相关规定进行抵扣。但是，一般纳税人转换到小规模企业后，就不能再使用专用发票作为财务凭证了，因此，要使用小规模已增值税专用发票作为财务凭证，需要按照政府的规定进行注册或改变小规模企业的资格。 拓展知识：工商局根据《企业所得税专用发票管理规定》，只有纳税人转变成一般纳税人后，才可以申请专用发票，此时纳税人需要重新登记，注册完成之后，才可以办理重新申请专用发票。