加计抵减的增值税一般是指纳税人申报的主动做出的增值税减免，这里可分为两部分：一部分为纳税人原来的增值税税款金额；另一部分为纳税人可以享受的增值税减免金额。对于账务处理，首先应将纳税人应缴的原有增值税税款金额分录进增值税应缴税款；再将可以减免的部分分录进应交税费-减免税款项中；最后，由减免税款项扣除增值税应缴税款项，得出实际应缴的增值税税款。