民办非企业的增值税免征入账的方式主要有两种：一是通过开具增值税专用发票 “增值税普通发票”，在增值税统计账簿中及时抵扣增值税；二是通过“其他”科目记录在产品销售收入等收入科目上，并在一定时间内按照月累计统计的形式弥补由于抵扣的增值税，达到免税的效果。 有关入账的步骤可以简述如下： 1、首先要在注册登记明确民办非企业免征税的具体税种； 2、然后，发票管理人要登记发票信息，并准备发票票据； 3、按付款条件，登记发票购买； 4、在应收账款明细表和应收账款科目总账中记录收款情况； 5、根据增值税统计账簿，及时抵扣相关税款或者按月累计统计弥补税款； 6、定期报送税务机关，申报纳税。 拓展知识：按照《中华人民共和国发展改革委员会、国家税务总局关于适用增值税减免税政策的通知》的规定，民办非企业的增值税免征针对的是国家指定的范围，如新农村等，除此之外，其它的民办非企业均不能享受增值税减免税的优惠政策。