是的，机票行程单可以报销，可以抵扣增值税。机票行程单主要报销的是差旅费用，可以在纳税时扣减税额，包括增值税。具体是根据机票行程单上显示的金额数值来决定是否可以扣减，如果行程单上显示的金额数值少于实际支出的金额，那么就可以抵扣增值税。拓展知识：增值税是一个抽象的概念，是指商品或服务的结算价格中所产生的税收。增值税税率一般是17%，在企业经营活动中，如果可以通过报销票据或者发票等方式把增值税扣除下来，可以节省税费，提高企业的利润。