关于公司网银年费的做账，首先可以分清楚哪些是网银相关的费用，如每月使用网银的手续费、网银的年费、网银服务费等；然后根据银行的要求，登记公司网银的入账情况，详细记录每一笔支付费用，结合公司网银年费制度进行核对，以及银行与本公司财务部门的沟通详细表明网银费用的支出情况；最后，定期检查，以确保网银费用的准确无误，并且确保及时缴费。