合理的账务处理需要按照规范实施。在开发票甲方代付农民工工资的情况下，首先要将发票内容以及金额准确填写，确保发票的真实性。之后，需要明确支付的收款方，并由甲方直接支付给农民工的工资，并要求甲方提供支付凭证。最后，需要做好记账工作。记账内容包括：一方为我们，借方记入工资支出款；另一方为甲方，贷方记入应付款账户。 拓展知识：在发票处理过程中，有时可能会出现账务纠纷，因此在开发票前，最好能够先和发票对方签署一份账务确认书，以确保双方权利义务的相互承诺，避免发生纠纷。