纳税人若当期按照规定调减的加计抵减额形成了负数，应当申报代扣代缴的方式。具体来说，纳税人应当在上一纳税年度的末日和当期的初始之间，形成的应税收入的可抵扣的部分并不小于当期准备抵扣的应税收入的金额。因此，纳税人应当将逾期未抵扣的应税收入与当期准备抵扣的应税收入的金额作比较，按照可抵扣部分最多为当期准备抵扣应税收入金额的原则，在纳税申报表中确定可抵扣应税收入金额，然后按照可抵扣金额申报应缴税款即可。