是的，企业回购股票会使所有者权益减少。企业回购股票是指企业使用自有资金以市价购回自有股票的行为。由于这种行为会减少股权总额，因此，所有者权益也会随之减少。当企业回购自有股票时，股权总额将减少，公司的股票价格也将上升，但总股权就会随之减少，因此，所有者的权益也就会随之减少。 此外，如果企业回购股票的费用超过了企业实际收入，那么在报表上也会造成所有者权益的减少。因此，企业回购股票使得企业的股票价格上升，但是也会使得所有者权益减少，从而影响企业未来的发展和运行。