公司之间的往来款一般是指两家公司之间由于业务往来而产生的货币资金，可以分为应收款和应付款。在做账时，首先需要根据双方签订的协议明确付款方式、期限、金额等，然后将应收款及应付款登记至账簿，并录入相关账目，当收到款项或扣除付款时，应做出相应记账，并做好凭证，以备核对查询。 拓展知识：一般来说，公司之间的往来款都应该通过银行账户进行支付，以便安全可靠，且发票和凭证都能够得到登记，以便追踪和核对。