跨区域涉税事项报告表作废的申请流程如下：首先，跨区域报告人应当准备好准备好跨区域涉税事项报告表，并将其提交至当地税务机关；其次，向税务机关申请作废；最后，税务机关审核通过后，持有申请作废手续的跨区域报告人意味着它的跨区域涉税事项报告表已经作废，并可以免于预缴税款。 例子：某公司有涉税事项需要跨两个省报告，因一定原因，需要申请跨区域涉税事项报告表作废，经当地税务机关审核通过，报告表作废后该公司可以免于付税。