要完成目录设置，首先需要登录到增值税发票开具系统，找到“分类管理”模块，然后选择“收入科目”，根据发票开具类型和科目性质，进行设置和维护，例如添加新的科目、删除无效科目、修改科目名称、查询科目信息等。此外，还需要进行科目的分级管理，对系统中科目进行分级，分为四级。最后一步是设置发票内容，在“发票内容”模块中，选择发票类型，维护发票内容，完成目录设置。