招标代理合同是按“合同税”来申报，也就是说招标代理机构与建筑公司在签订合同时，需要交纳一定比例的印花税。具体的税率因地区不同而有所差别，一般在0.05%-0.1%之间，招标代理机构在收取招标代理费时，需要把印花税的费用一并缴纳给政府。 拓展知识：印花税是指按照税法规定，对合同、协议、契约等文书进行税收征收的一种税种，是政府收取的一种专款，用于财政支出。印花税的征收方式多样，如按税额比例征收、按照固定额度征收等。