一般来说，一个月申报两个月工资的情况下，只能扣除一个5000元的社保费用。但是，具体要看本人在该月的实际领取工资，以及工资实际发放的月份。如果本人实际领取的工资，在该月发放的实际领取金额大于5000元，那么就会另外再扣除一个5000元的社保费用。 另外，在本人实际发放工资前，应当有一定的审核流程，以确保工资实际发放正确、合法。比如，公司在发放工资前，要进行工作表审查、工资结算审查、记账凭证审查等，以确保发放的工资的实际金额和发放时间正确。 拓展知识：企业职工在申报个税时，除了要准确填写本月实际收入和社保费用，还要填写过往十月外地非稳定收入，以计算出月应纳税所得额。