小规模纳税人开具的专用发票，税率是3%。而小规模纳税人开具的普通发票，金额在5000元以内是免税的，金额超过5000元部分才有税费。 一个具体的案例是，小规模纳税人A卖出一台机器，总价5500元，如果A开具了普通发票，那么前5000元的部分是免税的，只有500元的部分需要缴纳税款，税率为3%，税款共计15元。如果A开具了专用发票，整张发票都需要缴纳税款，税率为3%，税款共计165元。