软件著作权申报费可以计入研发费用科目，它是软件开发过程中的必要成本之一。软件申请费可以在研发费用，或特殊处理科目中记录，可以从软件研发费用账簿中按照账户汇总的方式进行支付，也可以按照“研发费用-专有研发费用-专利费”三级科目核算，并把申报费记录到“软件著作权申报费”中。例如，公司开发的技术产品，需要通过软件著作权申报费申请，就可以用“软件著作权申报费”科目记账，可以从软件研发费用账簿中按照账户汇总的方式进行支付，具体作业步骤是：先将申报费用登记到“软件著作权申报费”科目，然后由财务部门汇总该科目的支出，最后向商业银行付款报销。