申报第三季度工会经费，包括分公司支付的工资在内，是可以一起报的。首先，要明确工会经费的收支情况，针对支出，需要表明支出事项，金额以及与其他工会经费有关的法律法规和文件。其次，针对收入，要明确收入来源，收入的金额以及收入的用途。最后，还要将具体第三季度支付分公司的工资加到经费支出当中，按照实际的情况，完善相关的记录和凭证，完成整个报告的编制。