公司注销后，应将所有往来账目进行核对，并将核对正确的账目进行分类整理，将未结清的借贷双方的账目进行结清，以免出现纠纷。比如公司拖欠供货商款项，应核实相关资料后汇款给供货商，并将结款凭证档案化。另外，根据财务账目发票整理和核对坏帐，并记入坏帐准备，将不能收回的发票和账款报废等。总之，公司注销后，必须对往来账目进行彻底核对，才能尽可能地保证双方的权益。