是的，企业员工持有残疾证，可以免税。根据中国税法规定，残疾人有一定的税收优惠政策，可以在领取收入时享受优惠。企业员工持有残疾证可以享受收入税的减免，减免额度为全年应纳税额的1000元。此外，残疾人还可以免除购买和使用的商品的消费税。 拓展知识：此外，残疾人还可以申请残疾证，残疾证是残疾人享受政府提供的特殊优惠政策的凭证，这些特殊优惠政策包括安居补贴、交通补贴、就业补贴、教育补贴等等。