首先，检查增值税申报系统是否受到恶意攻击或其他安全问题的影响；其次，检查系统的运行环境是否受到定时停机或网络中断等因素的干扰；最后，检查系统的硬件或网络设备（服务器、存储设备）是否发生故障或通信中断，以此来分析增值税申报系统异常原因。如果发现异常原因，可以采取适当的措施来恢复增值税申报系统的正常运行，例如重新启动服务器或硬件设备，并处理网络中断问题等。