如果对方公司已经注销，那么我方是否要做进项税转出，这要取决于我方是否按照规定完成了相关的税务登记及纳税义务。根据《中华人民共和国税收法》第十六条的规定，对于进行销售或者进行进口业务的企业，应当在财务会计报表中按照有关规定登记进项税额，并依法缴纳税款。如果对方公司已经注销，那么我方是否应该做进项税转出，则要根据我方在进行该笔销售时是否已经办理了相关税务登记手续，及是否已经履行了纳税义务来确定。 拓展知识： 根据《税收征管法》第四十一条规定，被注销的企业应当自注销之日起，按照有关规定办理税务登记注销手续，并办理相关的税收缴纳，及财务报告报税等事宜，以确保税收征管的正常运行。