增值税扣税凭证主要有： 1、增值税专用发票：此类凭证又称“三联单”，包括购货方联、销货方联和税务机关联，是增值税付款的有效证明。 2、其他增值税税收凭证：包括收购发票、收购收据、收购单据、收购函件等。 3、增值税普通发票：此类发票是增值税纳税人开具的有效凭证，可以作为税务机关核实用，但不可作为抵扣税款的凭证。 4、增值税抵扣原始凭证：如进口税收缴款书、运输工具载货清单等，可以作为纳税人申请抵扣增值税的有效凭证。 5、其他增值税凭证：包括征收凭证、定额发票、代扣代缴凭证、税务机关凭证等。