进项税转出和红字发票的主要区别体现在其从属性上以及会记录的内容。进项税转出是企业收入税负的一部分，即在销售时对收到的国家税赋后，把扣除的税费转出，这一部分只反映在核算上，不反映在实际发票当中，而红字发票则是指开票金额比实际金额大的账单发票，它由于存在损失，所以会反映在发票上。 例如，一家公司在出售商品或服务后，产生销售额3000元，其中17%的增值税应被扣除，但由于某些原因，这部分只能出现在核算上，只能作为进项税转出，而不会出现在发票上；而如果发生亏损，公司在发票上可能会体现出开票金额大于实际金额，这就是红字发票。