不允许扣除。因为员工手机补助的报销只能用作他们的专用手机支出，不能用于个人手机支出。如果将该补助资金用作个人手机支出，违反了劳动法规定的专用资金的使用规定，实际上对社会财富的消耗极为不必要，应当受到法律的惩处。 拓展知识：企业补助有利于激励员工，充分发挥他们的积极性和创造力。同时，企业也可以结合实际情况，采取合理的补助形式，降低职工的非生产性支出，从而提高企业的效益。