申请个税扣错了退回的程序一般有以下步骤： 1.申请人应向个人所得税办公室提出书面申请，提供相关资料，说明申请原因； 2.个人所得税办公室审核申请材料； 3.若审核结论为有效，则办理退回所扣个人所得税的相关程序； 4.发放退税款。 同时，在申请退回时，申请人还应准备相关证明文件，例如：纳税申报表、企业发票、工资发放凭证等，以便加快审核程序。