土方工程发票可以计入土地成本，但是要注意土方工程属于减少成本项目，所以不能以投资获得直接收益来计入土地成本，而是应当以市场价格抵销原有土地价值的方式计入土地成本。例如，如果某个土地的价格为10000元，而实施土方工程后，该土地的价值可以提升到20000元，那么土方工程发票的价值就应当计入该土地的成本，使得总成本也提高到20000元。另外，为了确保土地成本的准确性，应当考虑土方工程发票中是否包括了税费、劳务费、物资费等因素。