多开工程发票账务的处理一般有以下几步： 1、首先，要根据发票的内容及编号等信息，判断是否存在多开发票的情况。 2、如果发票确实存在多开的情况，应当立即向税务机关进行申报。 3、若税务机关确认存在多开的情况，将会对相关公司处以罚款及其他行政处罚。 4、在申报和缴纳罚款之后，公司应当采取措施防止再次多开发票，并对已多开的发票进行记录，以便日后查询。 案例：某建筑公司在2020年10月份对一项工程发票多开了2张，其中一张发票编号为123456789，另一张发票编号为987654321。该公司应当立即向税务机关申报多开发票的情况，并缴纳相应的罚款，同时采取措施防止再次多开发票，并将多开的发票记录在案。