营改增后，工程分包的帐务处理主要包括：一是建立全面的记账核算体系，彻底实施增值税及附加税分包项目统一定价;二是根据分包合同精确核算分包费用，明确分包项目实际支出，合理安排财务支付;三是加强财务账务报表的调整，及时纠正财务账务报表，及时反映分包费用的实际支出情况；四是加强资金控制，建立有效的资金流向控制机制，有效控制分包费用的支出。